Le séquençage des ARN (RNAseq) est la méthode de référence pour réaliser les études transcriptomiques sans a priori. Elle est encore difficilement abordable à cause des coûts qui restent globalement élevés pour des études à grande échelle sur des dispositifs d’élevage ou des cohortes.
Le recours à des prélèvements semi/non invasifs est à privilégier pour des études en conditions d’élevage sur animaux vivants.
La présence de transcrits majoritaires de globuline (environ 80%) dans le sang total rend difficile l’exploitation de protocoles RNAseq « classiques » à partir de prélèvements sanguins. Dans ce protocole un bloqueur de globuline permet de s’affranchir de cette contrainte.
GGrâce à un financement du Carnot France Futur Elvage, la plateforme GeT-TRiX a mis en place une solution intégrée d’analyse transcriptomique par séquençage rationalisé, réduisant le cout global et l’empreinte environnementale, jusqu’au rendu d’un rapport complet d’analyses interprétable et valorisable par les biologistes.
Notre expertise
Idéal pour réaliser des analyses différentielles d’expression génique
Applicable à partir d’ARN total de faible quantité et/ou dégradé
Séquençage rationalisé des queues 3’ des transcrits
Abordable en termes de coûts/masse de données
Applicable sur un grand nombre d’individus
Performant sur sang total via l’utilisation de « bloqueurs de globuline » : Porcin et Humain 
Génétique
Expertise
Porteur de projet
Partenaires
Les autres projets
EcoFormulae
Formuler des aliments à faible impact environnemental et à coûts maîtrisés
Plateau transcriptomique GeT-TRiX
Service intégré d’analyse des petits ARN non codants par séquençage
DHM
Evaluer par simulation les stratégies de maîtrise des troubles de santé et de la reproduction en élevage bovin laitier
