La filière porcine représente à elle seule près de 40% du tonnage national de matière active médicamenteuse utilisée. Actuellement, les éleveurs se heurtent toujours à l’impossibilité de traiter individuellement les animaux malades. En effet, le nombre d’animaux rend difficile la détection d’une pathologie animal par animal et la conception de l’outil de traitement (pompes doseuses et conception de réseaux de distribution du médicament) oblige au traitement de toute une salle regroupant plusieurs dizaines d’animaux.

La maîtrise de la santé est alors essentielle d’une part pour des raisons  financières (coûts liés aux traitements, à la baisse des performances techniques des animaux et aux pertes); éthiques (consommateurs demandant des produits alimentaires sains et sans antibiotique) ; et environnementales (une bonne maîtrise sanitaire limitant les rejets de produits vétérinaires dans le milieu et les risques d’antibio-résistances).

Le projet Piglet vise à fournir une surveillance individuelle en temps réel des animaux qui, associé à un système de management, permettra d’alerter précocement les éleveurs lorsqu’un animal montre des signes de faiblesse. Pour ce faire, deux étapes sont nécessaires : la mise en place d’équipements permettant le recueil d’informations individuelles sur les animaux et la construction d’un modèle statistique avancé capable de valoriser ces informations pour réaliser une détection précoce de pathologie et alerter l’éleveur.

Preuve de l’intérêt de cette thématique, l’équipementier français d’élevage ASSERVA propose de participer financièrement (à hauteur de 40%) à la mise en place des équipements capables d’enregistrer le poids des porcelets et les comportements individuels alimentaires et hydriques sachant que ces derniers sont fortement liés à l’état de santé de l’animal.

Ce système, couplé avec un modèle statistique adéquat, peut permettre de détecter précocement un problème de santé chez un porc.
En partenariat avec l’IFIP-Institut du porc, l’objectif est d’utiliser les mesures des consommations alimentaires individuelles en temps réel pour identifier précocement l’apparition de pathologie permettant à l’éleveur de choisir une stratégie thérapeutique adaptée. Le développement de l’algorithme de détection précoce des pathologies donnera un important avantage concurrentiel à ASSERVA sur le marché en plein essor des outils technologiques d’aide au pilotage des élevages.

L’objectif de “COMBITAN” est d’examiner si la combinaison  de sources différentes de tannins  condensés (TC)-(une base de  Légumineuse,  le sainfoin déshydratés, et diverses ressources  de déchets  agro-industriels issues de l’industrie des noix) pourrait apporter des effets synergiques, chez les petits ruminants, pour améliorer leur santé (effets anthelminthiques (AH) sur les nématodes gastro intestinaux) et réduire les conséquences sur les fermentations ruminales (réduction de gaz à effets de serre et prévention des météorisations).

Trois ressources contenant des TC seront comparées= 1/ des granulés déshydratés de sainfoin; 2/ les coproduits de 3 espèces (ou cultivars) de noix et 3/ des prototypes de granulés “optimisés ” incluant des coproduits de noix dans des granulés de sainfoin  en se fondant sur des processus technologiques de déshydratation adaptés pour préserver la bioactivité des tannins.

Les 2 ressources contenant des tannins seront fournies par deux partenaires industriels (sociétés MG2mix et INOVfruit).

Le projet COMBITAN représente un modèle pour explorer, à l’échelle mondiale, le concept d’alicaments riches en tannins chez les ruminants associant effets antiparasitaires, nutritionnels et environnementaux. De plus, en terme de potentialités d’innovations industrielles, le projet pourrait conduire à valoriser certains coproduits de l’industrie des noix, jusqu’à présent assimilés à des déchets agro-industriels et développer des technologies pour préserver et stabiliser les tannins et autres métabolites bioactifs présents dans diverses ressources.

Poxvirose affectant le bétail, la dermatose nodulaire contagieuse (DNC) est une maladie d'importance économique majeure. Elle est largement distribuée au sein de la plupart des pays africains dans lesquels elle est endémique depuis 1989 et a progressivement affecté les pays du Moyen-0rient, la Turquie, le Kazakhstan, l'Azerbaïdjan, la Russie, mais aussi les pays européens. Jusqu'à ce jour, les stratégies de lutte se sont avérées peu efficaces à stopper la progression du virus.

Au travers d'une approche intégrée et multidisciplinaire associant des laboratoires des secteurs public (UMR 15/1309 CMAEE, UMR INRA/ENVT 1225 IHAP) et privé (MERIAL, IDEXX et Neovirtech), ce projet vise à développer de nouvelles stratégies de contrôle alternatives supportées par de nouveaux outils de lutte. Des études épidémiologiques vont être mises en œuvre en vue de développer de nouveaux modèles statistiques d'étude de la progression de la maladie visant à mieux comprendre l'interaction complexe entre les mouvements du bétail (driver économiques) et l'écologie des arthropodes vecteurs (drivers écologiques). L’objectif recherché est de développer des modèles prédictifs de la progression de la maladie dans les pays affectés et d'aider les autorités sanitaires à concevoir des stratégies de lutte mieux ciblées et plus efficaces. Des travaux entomologiques, ciblant les acteurs majeurs dans la propagation de la DNC que sont les vecteurs arthropodes, contribueront à la compréhension des mécanismes impliqués dans la progression de la maladie et fourniront des éléments stratégiques nouveaux à prendre en compte par les acteurs de terrain dans le cadre de la mise en œuvre des méthodes de lutte anti-vectorielle dirigées contre la DNC.
De plus, parmi les vaccins disponibles utilisés à ce jour, seules des souches vaccinales atténuées sont utilisées par les pays touchés.

Bien que ces souches soient efficaces dans la prévention de la maladie, des problèmes d'innocuité associés à des signes cliniques généralisés sont décrits sur le terrain. Afin d'améliorer les performances (innocuité, efficacité)  des souches vaccinales atténuées utilisée, les équipes de virologie du projet mettront sur pied une plateforme de recombinaison Capripoxvirus afin de permettre la construction dans des délais raccourcis de nouveaux candidats vaccinaux recombinants. Les modifications du génome des candidats vaccinaux visent ici d'une part à supprimer leur pathogénicité résiduelle et d'autre part à insérer un gène marqueur permettant de différencier les animaux naturellement infectés des animaux vaccinés (vaccins DIVA). En association à ces vaccins marqués, les équipes du projet vont œuvrer pour le développement de tests sérologiques diagnostic, ELISA DIVA et test au pied de l'animal (pen-side). L'objectif est de pouvoir rendre disponible de nouveaux candidats vaccinaux DIVA et tests diagnostic compagnons en vue des programmes de lutte et de surveillance sérologique entrepris sur le terrain. De tels outils viendraient satisfaire une attente évidente de la part des services vétérinaires déployés dans la lutte contre la DNC, en particulier puisque les vaccins DIVA font aujourd'hui cruellement défaut et que le panel d'outils diagnostic disponible est particulièrement limité.

Un projet d’actions de ressourcement scientifique

A l’échelle mondiale, les tiques sont les ectoparasites qui ont le plus de conséquences économiques sur l’élevage. En raison de leur régime alimentaire strictement hématophage, elles ont des conséquences négatives sur la santé animale à travers la déplétion sanguine, notamment dans les zones tropicales. De plus, les tiques transmettent de nombreux pathogènes, incluant les agents étiologiques de maladies tropicales majeures pour le bétail (théilérioses et babésioses bovines, cowdriose…) qui sont largement distribuées, notamment dans les départements et régions d’outre-mer (Nouvelle Calédonie, Antilles, île de la Réunion…). En Europe, l’impact des maladies à tiques chez les bovins est plus limité mais leur importance est renforcée par leur nature zoonotique. Comme les animaux de rente sont utilisés notamment par les tiques adultes (incluant l’espèce la plus fréquente en Europe, Ixodes ricinus, qui pique aussi l’homme) pour leur repas sanguin, ils constituent donc des hôtes importants pour les maladies vectorielles humaines (notamment la maladie de Lyme, maladie vectorielle la plus fréquente dans les régions tempérées de l’hémisphère nord).

Par ailleurs, la tique vectrice de la fièvre hémorragique de Crimée-Congo (avec un taux de mortalité de 40% chez l’homme), Hyalomma marginatum, présente aux marges de l’Europe (Turquie, Balkans…) utilise fréquemment les bovins pour son repas de sang au stade adulte.
Jusqu’à présent, la lutte contre les tiques repose principalement sur l’utilisation d’acaricides chimiques. Malheureusement, ces molécules peuvent avoir des effets négatifs sur l’homme, les animaux de rente (toxicose, changements comportementaux) et les écosystèmes (par exemple sur des organismes non-cibles comme les insectes coprophages). De plus, des résistances aux acaricides ont d’ores et déjà été observées chez des tiques dans différentes régions du monde contre toutes les molécules utilisées à ce jour. L’émergence de résistance chez les tiques favorise l’utilisation de doses encore plus importantes d’acaricides et aggrave encore les problèmes liés aux effets non-intentionnels des acaricides. Il y a donc un besoin urgent de développer de nouveaux acaricides qui vont cibler très spécifiquement les tiques et ainsi limiter leurs effets négatifs non-intentionnels.

L’objectif du projet « Xenobio-tick » est de séquencer en profondeur le transcriptome des tiques afin d’identifier et de caractériser de nouveaux gènes de neurorécepteurs, les plus divergents possible de ceux des insectes, qui seront utilisés comme cibles spécifiques aux tiques pour le développement de nouveaux acaricides. Ces nouveaux neurorécepteurs après avoir été identifiés seront caractérisés formellement afin de montrer leur sensibilité à certaines molécules. La variabilité génétique de ces récepteurs sera décrite, permettant ainsi d’estimer la potentielle durabilité de l’acaricide qui ciblera ce récepteur. Bien que le criblage haut débit d’un grand nombre de molécules sorte de la portée de Xenobio-tick, ce projet, en rendant disponible des récepteurs neuronaux exprimables et fonctionnels en système hétérologue, constituera une avancée majeure afin de développer un criblage automatisé de molécules ciblant ces récepteurs.
Cette avancée devrait permettre le développement d’une collaboration avec des partenaires industriels pour le développement de nouveaux acaricides à forte efficacité et présentant  moins d’effets non-intentionnels.